Le traitement de première intention des maladies auto-immunes systémiques repose sur l’utilisation de différents types de médicaments immunosuppresseurs ou immunomodulateurs, utilisés seuls ou en association, selon des schémas standardisés dits de référence. Leur utilisation prolongée, lorsque la maladie auto-immune est réfractaire aux traitements de référence, est associée à une morbidité et une mortalité élevées. Plus récemment, l’utilisation de médicaments de thérapies innovantes, dont l’effet thérapeutique est médié par des cellules génétiquement modifiées ou non, constitue une approche prometteuse pour le traitement des maladies auto-immunes, notamment : a) les cellules stromales mésenchymateuses aux propriétés immunomodulatrices, antifibrosantes et pro-angiogéniques et b), les lymphocytes T génétiquement modifiés pour exprimer un récepteur chimérique à l’antigène (CAR-T cells) permettant de cibler et d’éliminer des lymphocytes B autoréactifs, et de rétablir la tolérance dans les organes affectés. L’utilisation des thérapies cellulaires innovantes, cellules stromales mésenchymateuses ou CAR-T, dans des indications d’exception chez des patients atteints de maladies auto-immunes systémiques sévères résistantes aux traitements classiques soulève des questions essentielles par rapport aux médicaments traditionnels, dans la définition des circuits de production et de délivrance, mais aussi dans la prise en charge clinique et le suivi des patients traités. Le présent atelier avait pour but : a) d’identifier les prérequis permettant aux hôpitaux français de s’organiser efficacement pour répondre aux sollicitations de promoteurs d’essais cliniques visant à évaluer l’utilisation des cellules stromales mésenchymateuses ou des CAR-T cells dans les maladies auto-immunes et b) de détailler chaque étape du parcours de soins des patients traités par médicaments de thérapies innovantes pour leur maladie auto-immune, en soulignant le rôle fondamental d’un binôme spécialiste de la maladie et spécialiste en thérapie cellulaire innovante. Les considérations relatives à la sécurité des patients sont primordiales pour la sélection des patients, qui doit être validée collectivement en réunion de concertation pluridisciplinaire, sur la base d’une évaluation détaillée clinique et paraclinique récente (moins de trois mois) du patient. La procédure de traitement par cellules stromales mésenchymateuses et CAR-Tcells et le suivi des patients sont effectués dans des centres accrédités par la SFGM-TC, en étroite collaboration avec les spécialistes des maladies auto-immunes considérées.